- Docente: Nicola Storelli
- Docente: Mauro Amedeo Tonolla
Objectif
À l'issue de ce stage, les étudiants seront capables de :
Mettre en pratique des compétences de terrain en microbiologie aquatique : collecte d'échantillons, mesures in situ, analyses en laboratoire et interprétation des données.
Comprendre le rôle des facteurs abiotiques (lumière, température, oxygène, nutriments, etc.) dans la structuration des communautés microbiennes aquatiques.
Décrire et comparer les différents métabolismes microbiens en fonction des gradients environnementaux dans des systèmes stratifiés, comme le lac méromictique de Cadagno et les tapis bactériens des marais.
Vivre une expérience scientifique immersive et collaborative, dans un environnement naturel exceptionnel favorisant l'apprentissage et l'échange.
Mettre en pratique des compétences de terrain en microbiologie aquatique : collecte d'échantillons, mesures in situ, analyses en laboratoire et interprétation des données.
Comprendre le rôle des facteurs abiotiques (lumière, température, oxygène, nutriments, etc.) dans la structuration des communautés microbiennes aquatiques.
Décrire et comparer les différents métabolismes microbiens en fonction des gradients environnementaux dans des systèmes stratifiés, comme le lac méromictique de Cadagno et les tapis bactériens des marais.
Vivre une expérience scientifique immersive et collaborative, dans un environnement naturel exceptionnel favorisant l'apprentissage et l'échange.
Descriptif
Le stage pratique se déroule à 2000 m d'altitude au milieu des Alpes au Centre de Biologie Alpine (CBA) pour une durée de 5 jours, avec excursions sur le terrain et prélèvements d'échantillons de divers écosystèmes aquatiques comme le lac méromictique de Cadagno et le marais de tourbe adjacente.
Dans le contexte de l'hydrobiologie microbienne, l'écologie de la stratification fait référence à l'étude de la structure et du fonctionnement des communautés microbiennes dans les différentes strates des systèmes aquatiques. Chaque couche représente une niche écologique unique avec des conditions environnementales spécifiques, telles que la température, la luminosité, la disponibilité des nutriments et les niveaux d'oxygène. Ces variations créent des gradients qui déterminent la répartition et les activités des micro-organismes.
Deux phénomènes particuliers de stratification peuvent être observés dans la vallée de Piora, l'un sur 20 mètres (lac de Cadagno) et l'autre sur moins d'un centimètre (tapis bactérienne). Le lac de Cadagno est composé de deux couches d'eau qui ne se mélangent jamais, grâce au méromixis crénogène produit par la géologie particulière de la vallée de Piora. La couche inférieure, le monimolimnion, a la particularité d'être complètement anoxique, et favorise donc le développement de microorganismes ancestraux anoxigènes. Les tapis bactériens dans les marais constituent un système stratifié fascinant à petite échelle. On y trouve généralement quatre couches présentant des caractéristiques métaboliques extrêmement différentes.
Les facteurs abiotiques sont à la base de la stabilité de la stratification, mais ils sont également capables de la rendre "dynamique", en particulier les facteurs physiques, qui seront mesurés et calculés mathématiquement.
La partie pratique sera complétée par des présentations théoriques sur les différents sujets et des discussions (par les étudiants et les participants) sur des sujets liés à l'hydrobiologie microbienne.
Dans le contexte de l'hydrobiologie microbienne, l'écologie de la stratification fait référence à l'étude de la structure et du fonctionnement des communautés microbiennes dans les différentes strates des systèmes aquatiques. Chaque couche représente une niche écologique unique avec des conditions environnementales spécifiques, telles que la température, la luminosité, la disponibilité des nutriments et les niveaux d'oxygène. Ces variations créent des gradients qui déterminent la répartition et les activités des micro-organismes.
Deux phénomènes particuliers de stratification peuvent être observés dans la vallée de Piora, l'un sur 20 mètres (lac de Cadagno) et l'autre sur moins d'un centimètre (tapis bactérienne). Le lac de Cadagno est composé de deux couches d'eau qui ne se mélangent jamais, grâce au méromixis crénogène produit par la géologie particulière de la vallée de Piora. La couche inférieure, le monimolimnion, a la particularité d'être complètement anoxique, et favorise donc le développement de microorganismes ancestraux anoxigènes. Les tapis bactériens dans les marais constituent un système stratifié fascinant à petite échelle. On y trouve généralement quatre couches présentant des caractéristiques métaboliques extrêmement différentes.
Les facteurs abiotiques sont à la base de la stabilité de la stratification, mais ils sont également capables de la rendre "dynamique", en particulier les facteurs physiques, qui seront mesurés et calculés mathématiquement.
La partie pratique sera complétée par des présentations théoriques sur les différents sujets et des discussions (par les étudiants et les participants) sur des sujets liés à l'hydrobiologie microbienne.